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環(huán)境核酸提取磁珠法

本試劑盒是為環(huán)境樣本DNA提取而專門設(shè)計(jì)的,適合于從各種環(huán)境拭子、土壤、糞便、尿液以及培養(yǎng)基中微生物,目前廣泛應(yīng)用的例子:如豬場(chǎng)土壤、底泥、漏縫地板污物以及各種動(dòng)物糞便、尿液,環(huán)境,采用棉拭子蘸取足量此類樣品,從中提取高產(chǎn)量高純度的核酸DNA,提取的DNA可直接用于PCR、測(cè)序等分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。

【產(chǎn)品名稱】

通用名稱:DNA/RNA病毒環(huán)境樣本核酸提取試劑盒

英文名稱:DNA/RNA virus nucleic acid extraction kit for environmental samples

【包裝規(guī)格】16T/板×2板  ;32T/盒(預(yù)封裝)

【預(yù)期用途】

本試劑盒是專門從養(yǎng)殖環(huán)境、運(yùn)輸車輛、養(yǎng)殖人員、屠宰場(chǎng)等環(huán)境中提取DNA而設(shè)計(jì)的。試劑盒采用磁珠法純化技術(shù),并結(jié)合獨(dú)創(chuàng)的腐殖酸吸附劑技術(shù),適合于從各種養(yǎng)殖環(huán)境拭子、土壤(豬場(chǎng)附近3公里內(nèi))、豬的糞便、豬尿液、豬唾液以及運(yùn)送飼料、生豬的車輛表面等進(jìn)行非洲豬瘟病毒的篩查。目前廣泛應(yīng)用的例子:如豬場(chǎng)內(nèi)的土壤,豬的糞便,豬的唾液,養(yǎng)殖飼料中;試劑盒能夠從此類樣品中提取高產(chǎn)量高純度的總DNA 。

【實(shí)驗(yàn)原理】

試劑盒是采用高結(jié)合力的納米磁珠為基質(zhì)。磁珠在高濃度離子化劑(如鹽酸胍或異硫氰酸胍)條件下,可通過(guò)氫鍵和靜電等物理因素吸附核酸而形成磁珠核酸復(fù)合物,而蛋白質(zhì)或其它雜質(zhì)不被吸附而去除。吸附了核酸的磁珠經(jīng)洗滌去除蛋白質(zhì)和鹽,最后可以用低鹽緩沖液(如Buffer TE)或水,洗脫出納米磁珠上吸附的核酸。得到的核酸純度高,可直接用于各種下游實(shí)驗(yàn)。此外,S3-Cleanup Buffer溶液是我們獨(dú)創(chuàng)的腐殖酸吸附劑,該吸附劑可選擇性吸附DNA樣品中的腐殖酸等抑制因子,提高DNA純度。

主要組成成分

試劑盒組成

K3135-32

純化次數(shù)

32次

S1-Lysis Buffer

50 ml

S2-Lysis Enhancer

5 ml

S3-Cleanup Buffer

25 ml

Dry beads Tube

32個(gè)

10次預(yù)分裝板

-

16次預(yù)分裝板

2塊

說(shuō)明書

1份

【儲(chǔ)存條件及有效期】

室溫保存,保存得當(dāng)可穩(wěn)定使用12個(gè)月。

【注意事項(xiàng)】

1、S2-Lysis Enhancer 使用前請(qǐng)先將其60℃孵育至透明溶解狀態(tài),由于液體粘稠,移取液體時(shí),慢吸快放,確保移取液體用量。

2、不同批次、不同組分試劑不能混用。

【核酸提取】

1.樣品處理

1.1 糞便、污泥、養(yǎng)殖飼料

取<0.25 g此類樣本加入Dry beads Tube中,加入900 μl S1-Lysis Enhancer渦旋徹底、混勻。

(此步驟中若飼料、污泥吸水過(guò)多,可以適當(dāng)曾加S1-Lysis Enhancer 的用量。)

1.2 擦拭環(huán)境的抹布、拭子

取少量擦拭環(huán)境的抹布或拭子到15ml 或50ml離心管中,加入1 ml PBS 緩沖溶液浸泡后,用鑷子擠壓抹布或拭子,取250 μl液體至Dry beads Tube中, 加入900 μl S1-Lysis Enhancer渦旋徹底、混勻。

1.3 含豬尿液、養(yǎng)殖用水

使用負(fù)壓設(shè)備,配合抽濾裝置抽濾50ml~200mL的養(yǎng)殖用水(推薦使用0.22 μm的微孔過(guò)濾器配合注射器進(jìn)行過(guò)濾50ml的養(yǎng)殖用水),將微孔過(guò)濾器中的濾膜取出,用剪刀剪碎放入Dry beads Tube中, 加入900 μl S1-Lysis Enhancer渦旋徹底、混勻。

2.加入100μl S2-Lysis Enhancer 溶液至樣品中,65 ℃孵育10 min。

3.劇烈渦旋震蕩10min。

(此步驟可選用研磨儀,頻率:6.5 m/sec ,處理時(shí)間:30S,10個(gè)循環(huán))

4. 12000 rpm離心5 min,轉(zhuǎn)移上清600μl到新的1.5ml的離心管中。

(注意:離心后上清表面可能出現(xiàn)一層雜質(zhì),避免吸取這些雜質(zhì),因?yàn)檫@些雜質(zhì)會(huì)影響下游的擴(kuò)增)

5. 加入400 μl S3-Cleanup Buffer,立即徹底混勻。

6. 12000rpm離心2min,轉(zhuǎn)移全部上清液(約600μl)到 預(yù)分裝板的孔(1\2)、(7\8)中。打開(kāi)核酸自動(dòng)提取儀,選擇編輯程序并命名“environmental samples”,按照下表進(jìn)行編輯。

備注:因?yàn)?6孔板孔內(nèi)最大體積2.2ml,液體多余1ml會(huì)溢液,可將600μl的液體分成兩個(gè)300μl分別加入孔(1、2)或(7、8)中,孔1、2為一個(gè)樣本,孔7、8為一個(gè)樣本。

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7. 插入磁棒套,運(yùn)行編輯好的程序,25min左右程序結(jié)束,轉(zhuǎn)移洗脫孔6、12中的DNA至新的離心管-20℃保存或直接進(jìn)入q-PCR 檢測(cè)。

【檢驗(yàn)結(jié)果的判定】

DNA純度:OD260/OD280≈1.7~2.0 (>2.0,表明有RNA污染;<1.7,表明有蛋白質(zhì)、酚等污染)

【產(chǎn)品性能指標(biāo)】

1. 本產(chǎn)品批內(nèi)、批間差異<5%。

2. 利用儀器提取時(shí),可同時(shí)提取1-32個(gè)樣本,結(jié)果穩(wěn)定且重復(fù)性好。

【參考文獻(xiàn)】

1. Boom, R., C.J.A. Sol, M.M.M. Salimans, C.L. Jansen, P.M.E.W. Dillen, and J. van der Noordaa. 1990. Rapid and simple method for purification of nucleic acids. J. Clin. Microbiol. 28:495–503.